Welcome on board!<br><br>I didn't look up that sugya itself, but it could be that it was a Mishna Rishona Mishna Achrona thing. Like the reason that the Halacha in Machlokes VeAchar Kach Stam is different than in a Stam VeAchar Kach Machlokes.<br><br>Also, regarding who actually wrote the Mishna - it's a Machlokes Rashi (who said (in Eiruvin, in the Samechs on the sugya of More Halacha Bifnei Rabbo) that the Mishna wasn't written in the Gemara's time) and the Rambam (who said that Rebbi wrote the Mishna). <br><br>I heard that it boils down to the two Girsas of Rabbi Sherira Gaon's famous letter.